สถานีตำรวจภูธรเมืองปัตตานี ได้เข้าร่วมการประเมินเพื่อวัดระดับคุณธรรมและความโปร่งใสในการดำเนินงานของหน่วยงาน ตามโครงการประเมินคุณธรรมและความโปร่งใสในการดำเนินงานของหน่วยงานภาครัฐ (Integrity and Transparency Assessment: ITA) ซึ่งดำเนินการโดยสำนักงานคณะกรรมการป้องกันและปราบปรามการทุจริตแห่งชาติ (สำนักงาน ป.ป.ช.) โดยเริ่มการดำเนินการตามโครงการดังกล่าวตั้งแต่งบประมาณ พ.ศ. 2566 เป็นต้นไป